HPV感染和生殖器疱疹是两种不同的疾病，是两种没有必然联系的疾病，但人体免疫力低的时候，两者是可以同时发生的。
生殖器疱疹是以单纯疱疹病毒二型为主，但是一型在部分患者中也可见，可造成皮肤黏膜交界处急促型的水泡聚集的一种疾病，比如在人的口周、生殖器周围，发生的红斑的基础上，有急促型水泡聚集的现象，我们管他叫单纯疱疹病毒感染，发生在生殖器部位的我们称之为生殖器疱疹，属于性病中的一类。
而HPV病毒是嗜皮肤黏膜的，属于另一种病毒感染，感染后的表现形式也与单纯疱疹病毒感染的表现是不一样的。
HPV病毒分为高危型和低危型，HPV低危型会引起我们所说的瘊子、扁平疣、寻常疣、跖疣等，表现为疣状增生的改变，严重的也可引起皮肤黏膜的癌变；而高危型的HPV是引起宫颈癌的一个重要致病因，所以这是两个完全不同的病例表现，但是这两种病毒都可以通过这种性传播传染的，是属于性传播疾病的。
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刘彦春，北京地坛医院皮肤性病科主任医师、副教授、医学博士。全国子宫颈癌防治协作组成员，北京首批256位医学科普专家。研究领域：性传播疾病（尤其对HPV病毒感染造成的各类尖锐湿疣和宫颈疾病）、女性下生殖道感染、艾滋病、常见皮肤病。